二是削夺不驯服的诸王。如齐王专横暴戾，谷王反复小人，阴谋不轨，因废去齐、谷藩封。岷王在昆明与镇守官沐晟关系紧张，成祖责岷王并将岷王徙封湘西武冈，夺去护卫。周王是成祖同母弟，虽赏赐甚丰厚亦不使其地处中土开封而拥重兵，于是夺周王护卫。这些举动使各藩都知悉了成祖以藩封拥有护卫为忧，每有所责即自请向朝廷纳还护卫，藩王护卫遂渐次被削夺。
三是借助尊礼守法的藩王的力量以管理诸王。在藩王中楚王朱桢和蜀王朱椿号称最尊礼守法的贤王，楚王年长，进封为“宗正”，使掌宗人府事务，代皇帝成为朱氏宗族的大族长。又借楚、蜀的力量处理谷王谋反事件，称赞蜀王对待同母弟谷王不包庇，大有周公安王室之心。
强藩威胁皇权之忧解除了，只是原来设在长城一线绵延强悍的防御力量也随之消失，诸王守边结束，该上马的是天子自己守边了！
明朝承元之后，与退到漠北的蒙古族势力始终是紧张的敌对关系，这是明朝历史的一大特征，也是太祖载入《皇明祖训》忡忡忧心的重大问题。太祖以诸王守边，寄希望于诸亲子，所以定都南京。成祖削夺诸王兵权且徙封内地，但抵御蒙古进攻的力量却不能减少，故而成祖即位以后常常亲临北方边防指挥部署，改北平为北京，经常驻跸原来的旧藩邸，实行天子守边。他还在北京设置了一个专门的“行部”以处理日常政务。北京事实上在永乐初年就已经成为了明朝的政治中心。