大野这才根据外相的指示，吞吞吐吐地把来意说明。
陈公博听罢稍作思考说：“不就是想让我回去吗？我没什么，我绝无留连之意，通知一到，我便立即动手回国，绝对不会让贵方有所为难。”
10月1日，陈公博等人在日本外务省官员的陪伴下，由京都乘火车前往米子。因途中遇风雨，在福冈又住了一夜，直到10月3日才正式登上飞机。
何应钦派往日本的是一架运输机。除驾驶人员外，还有宪兵连长1人，士兵8人。他们在米子机场逐个验明陈公博等人，检查后送进飞机。有趣的是，押送名单里没有陈公博妻子李丽庄的名字，而李丽庄也到了机场，宪兵不让她上飞机，李丽庄还偏要上，又哭又闹。最后还是陈公博好言相劝，李丽庄才暂时留在日本了。
飞机抵达南京时，因事先封锁消息，南京市民均不知道陈公博等人被押回。机场上一片寂静，只有宪兵在等候。陈公博等人下了飞机后，分别被押上停候在机场上的吉普车内，由武装军警开路，直驶何应钦的陆军总司令部。
本来，何应钦是准备将陈公博一行安顿在司令部二楼的办公室内暂住的，并且准备好了床铺，但后来他又改了主意，将陈公博一行送往城南的宪兵司令部里拘禁。
陈公博一行在宪兵司令部里关了约一个多月，直到12月份，才被送进宁海路25号，和陈璧君、褚民谊等大汉奸们汇集在一起了。