但此时全国各地反日情绪之高涨，远非这个徒有其表的授勋能够缓解的。因为山东反日声势最高，北京政府遂撤掉在山东颇受非议的马良，改由皖系将领田中玉出任督军。1月3日，学联提出撤换警察厅长金荣桂、教育厅长袁立意，同时要求政府抚恤伤者，田中玉不欲事态扩大，接受了学界的要求。5日，北京各校教职员则到教育部向部长傅岳棻“献旗”，上书“寡廉鲜耻，恋栈不去”，要求撤换这位皖系的教育部长。9日，国务总理靳云鹏亲自接见教职员代表，表示会在短期内撤换傅岳棻，学潮才算在12日逐渐平息。
北京的学潮渐退，南方却又风云突变，17日，曹锟将一封电报转给北京政府，电报是吴佩孚发来的，在电报上吴佩孚称直军在湖南戍守两年，如今战士们都思乡情切，加上积欠军饷使部队陷入困境，所以“北望叩首，涕泣哀恳”，要求撤防回到直隶。电报到了徐世昌的手里，徐世昌缄口不语，靳云鹏又去找段祺瑞请示，段祺瑞也不发一语。但不说话的徐世昌和靳云鹏是不知道该怎么办，不说话的段祺瑞却是知道只能怎么办，吴佩孚南下时寂寂无名，再回来可就是海内虎将，若与曹锟合兵一处，皖系江山立时就会土崩瓦解。因此，段祺瑞密令沿途各皖系军阀，无论如何都要阻止吴军北归。