戴震治经也重视义理。戴氏之学并非以诸经训诂自限，他是要以训诂为手段，去探求六经蕴涵的义理，通经以明道。戴震所著《孟子字义疏证》是用文字训诂的方式阐发孟子学说，为批判理学的佳作。他指出：“理者，察之而几微，必区以别之名也，是故谓之分理。在物之质，曰肌理，曰腠理，曰文理（亦曰文缕，理、缕，语之转耳）；得其分则有条而不紊，谓之条理。”[22]把理视为事物的条理，由此推导出“理在情中”、“理在欲中”的结论，有力地批判了理学。
戴震在算学、天文学、地理学方面也颇有研究。《九章算术》为古代数学名著，已失传，戴震从《永乐大典》中将其零散错乱的文本整理成编，使这部数学名著重放光彩。他又从《永乐大典》中辑出诸种算经校正《五经算术》。所著《勾股割圆记》采用西方数学对勾、股、弦与圆的关系作了详尽的论述。
继戴震以后，皖派嫡传主要师承戴氏音韵、文字、训诂等治经方法，但戴氏的义理之学后继乏人。