市净率对很多企业来说没有任何意义，特别是服务性企业。如果用市净率去给某公司估值，将无法按照极少的账面价值去评估公司的市场垄断地位，因为无形资产是导致该公司如此成功的最大的因素。市净率也可能导致投资者对一家制造业企业进行错误估值，因为3M公司的价值大部分来源于它的品牌和创新的产品，而不是来自工厂的规模和存货的质量。
例如，在过去的5年间，诺基亚的市净率大约是14％，而竞争对手摩托罗拉公司的平均市净率则是3.1％。导致这种差别的主要原因是诺基亚的平均净资产收益率为29％，而摩托罗拉的平均净资产收益率只有3％。很明显，一家有很高账面所有者权益的公司更有价值，因为它的账面价值能增长得更快。
投资者应当明白任何估值方法都是有一定局限性的。要知道它们使用的范围才能够对该企业的股票的价值有个准确评估，判断出一个合理的价格。但用市销率估值同样存有缺陷：如果一家公司披露有数十亿元销售收入，但每一笔交易都亏损，盯住股票的市销率就会比较困难，因为我们对公司将产生什么水平的收益没有概念。此外，在考察市净率时，还要注意与之相关的净资产收益率。一家相对于同行或市场市净率低且有高净资产收益率的公司可能是一个潜在的黑马股，但是在单独使用市净率给股票估值之前，还要做某些深度挖掘工作。