雍正十年七月，噶尔丹策零亲率大军至厄得尔河源（外蒙古乌里雅苏台东北境），三音诺颜王策凌调蒙古兵三万人，大破策零军，满洲兵不敢邀击败军归路，策零得收残兵遁去。
八旗兵在战争中，完全暴露了其不堪一击的丑形，三音诺颜王策凌每战必胜，更使清朝引为北方未来的隐忧。自康熙五十六年与策妄构兵，十余年来，靡饷七千余万两，国库渐感艰难，雍正十二年，许策零议和。
乾隆十年，策零死，准部内乱。弘历用降酋阿睦尔撒纳为向导，二十年，清兵分北、西两路出击，杀准部大酋达瓦齐。二十一年，阿睦尔撒纳据准部叛。二十二年，清将军成衮札布从北路（乌里雅苏台）、将军兆惠从西路（巴里坤），乘准部内乱，诸部离散，长驱进占伊犁，阿睦尔撒纳逃入俄罗斯境，病死。清军屠杀准部人，深山荒野，无地不搜，小部落数十百户，也不让一人生存。准部盛时有户二十余万，人口六十余万，战败后，清军屠杀约十之五，疫死约十之二，逃入俄境约十之三。
（乙）新疆天山南路（回部）
天山南路居民信奉回教，因称为回部。清军占领准部，将军兆惠遣使招降诸回酋。回民数十万户拥酋长博罗尼都（大和卓木）、霍集占（小和卓木）抗清，只有库车、拜城、阿克苏三城的阿奇木伯克（官名）鄂对等走伊犁降兆惠。乾隆二十三年，兆惠率鄂对等攻回部。二十五年，兆惠军由乌什向喀什噶尔，富德军由和阗向叶尔羌，大小和卓木弃两城越葱岭西走，死。清尽有天山南北两路，称为新疆。设伊犁、塔尔巴哈台、乌鲁木齐、喀什噶尔四镇，将军驻伊犁。