朱棣就陷入了这个矛盾之中，他是皇帝不假，但朱棣在外期间经常或外出征战或巡视北京等，总之经常不在正牌首都南京待着。皇帝可以外出，但全国汇聚到南京的政务需要有人处理啊，于是朱棣就让太子监国，替他处理政务。太子如果处理得不好，朱棣自然是要大发雷霆的，但即便太子行政得当，朱棣还是会感到不快，因为太子越能干，追随他的人就会越多，朱棣感到被架空的威胁就会更大。所以我们会在史书中看到朱棣经常做出一些自相矛盾的举动。朱棣每次出征前都要赋予朱高炽相应的理政权力，根据朱棣的指示除了文武官员的升降，藩属国的朝贡，边境军队调拨这几件大事需要向朱棣请示以外，其余的政务全都由朱高炽自行处理。
看起来朱高炽的自主权很大，然而多疑的朱棣又不断对朱高炽的行为加以限制，比如朱高炽处理政务就必然要接触大小官员，但朱棣为了防止百官和朱高炽私下勾结，又特别规定但凡太子与大臣见面必须在公众场合，而且大臣不能单独与太子见面，必须结伴才行，并且这一切都需要有专门人员进行记录，以方便朱棣随时查阅。前内阁首辅解缙就是违反了这一条，被朱高煦趁机告发，最后被迫害致死，而解缙之死很难说没有朱棣杀鸡儆猴的成分在里面。