由于形势危急，吏部尚书夏邦谟上疏皇帝，请陛下上朝接见文武百官，否则无法安定危局，朱厚熜已经许久没上过朝了，尽管内心是抗拒的，现在也只好答应下来。群臣都十分开心，这么多年总算是可以看到皇帝了，大家等到太阳都快落山了，嘉靖皇帝才出现在奉天殿里。他没有说一句话，只是让徐阶拿着敕谕到午门，由其他官员宣读，责备大臣们不负责任，渎职懈怠，以后要是再敢如此，必定严惩不贷。骂完人，他老人家就回西苑了。群臣跪在午门外听旨意，个个战战兢兢，皇帝的口气如此之重，心里当然害怕了。
虽然明朝没有同意俺答互市的要求，但他们实际上也没有攻下京城的打算。财物抢够了，就开始退兵，先从巩华城进犯天寿山诸陵寝，再抢掠西山、良乡以西等地。敌人走了，嘉靖皇帝要开始算账了，兵部尚书丁汝夔御敌不利，让他当替罪羊，平息王侯将相、庶民百姓的愤怒。大家的财产都被蒙古人抢走了，妻离子散，家破人亡，早就不满，需要一个人作为发泄对象。丁汝夔向严嵩求救，严嵩说包在我身上，决不让你死。结果一听皇帝的咆哮声，严嵩就吓得不敢吭声，丁汝夔难逃被杀的噩运，临行时还说，是严嵩误了他。妻子被流放到三千里外，儿子到东北铁岭卫戍边；另一位按兵不动的兵部左侍郎杨守谦，也被嘉靖皇帝给处分了，身首异处。此战中，京营士兵表现得一塌糊涂，京营提督太监高忠、成国公朱希忠都被罢免。派户部侍郎骆顒到蒙古人强掠过的城市进行慰问，掩埋死者，赈济困难群众。